(資料圖片僅供參考)

莫斯科物理技術(shù)學(xué)院的研究人員及其同事首次成功地使用 RNA 測(cè)序作為癌癥診斷免疫組織化學(xué)的替代方法。他們的研究發(fā)表在Biomedicines上。

常規(guī)用于癌癥診斷的方法依賴于腫瘤組織切片的免疫組織化學(xué)染色。它允許檢測(cè)表征惡性生長(zhǎng)的標(biāo)記蛋白的存在和濃度。該過程包括將腫瘤樣本浸入熱石蠟中。冷卻后，一塊石蠟化組織被切成薄片，然后染色并用顯微鏡研究。由此產(chǎn)生的圖像表明腫瘤是否是惡性的以及它的分子類型是什么。這些信息對(duì)于選擇正確的療法至關(guān)重要。

另一種方法，RNA 測(cè)序涉及確定細(xì)胞中存在的每個(gè) RNA 的序列和分子數(shù)量。生成的數(shù)據(jù)稱為轉(zhuǎn)錄組，反映了細(xì)胞中所有基因的活性。為了分析如此龐大的數(shù)據(jù)陣列，生物信息學(xué)家采用專門的算法并為不同的人體細(xì)胞和組織編譯轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)。

最近發(fā)表在《生物醫(yī)學(xué)》上的論文的作者提出，RNA 測(cè)序可作為傳統(tǒng)免疫組織化學(xué)染色的替代和補(bǔ)充技術(shù)。在這種方法下，可以在分析中使用相同的石蠟化腫瘤碎片。這意味著不需要額外的活檢，并且這兩種技術(shù)將很容易結(jié)合起來。

“我們首次表明，這兩種方法的結(jié)果對(duì)于選定的一組生物標(biāo)記物是完全一致的。只是免疫組織化學(xué)需要更多的實(shí)驗(yàn)——每個(gè)生物標(biāo)記物都需要一個(gè)實(shí)驗(yàn)——這意味著需要更多的生物材料. 反過來，RNA 測(cè)序使我們能夠定量描述所有蛋白質(zhì)編碼基因的工作，其中大約有 20,000 個(gè)!首席研究員 Anton Buzdin 說，他是 MIPT 轉(zhuǎn)化基因組生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人，也是 Oncobox 研究部門的負(fù)責(zé)人。

在他們的研究中，研究人員表明通過 RNA 測(cè)序測(cè)量的四種腫瘤標(biāo)記基因的表達(dá)水平與免疫組織化學(xué)染色的結(jié)果之間存在明顯的相關(guān)性。

“我們相信 RNA 測(cè)序在醫(yī)學(xué)診斷方面有著廣闊的前景。希望我們的最新研究能讓這個(gè)未來更近一點(diǎn)，”Buzdin 補(bǔ)充道。

關(guān)鍵詞：