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大連化物所發(fā)布蛋白質(zhì)-納米材料界面相互作用的結(jié)構(gòu)質(zhì)譜表征實(shí)驗(yàn)手冊(cè)

來(lái)源: 大連化學(xué)物理研究所2023-08-15 12:25:15
  


【資料圖】

近日,中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所生物技術(shù)研究部生物分子結(jié)構(gòu)表征新方法研究組研究員王方軍團(tuán)隊(duì)發(fā)布了表征蛋白質(zhì)-納米材料界面相互作用精細(xì)結(jié)構(gòu)的賴氨酸反應(yīng)性分析-質(zhì)譜(LRP-MS)實(shí)驗(yàn)手冊(cè)。

微/納米材料在生命科學(xué)、醫(yī)藥健康、生物催化等領(lǐng)域廣泛應(yīng)用,探討蛋白質(zhì)與材料之間的界面相互作用分子機(jī)制對(duì)生物醫(yī)用材料的安全性評(píng)價(jià)、納米藥物的毒性評(píng)估和理性設(shè)計(jì)、生物-無(wú)機(jī)功能雜合體的改性和催化活性提升等具有重要意義。然而,現(xiàn)有光譜學(xué)等方法只能表征材料引起的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)整體變化情況,蛋白質(zhì)-材料界面相互作用分子細(xì)節(jié)的探測(cè)面臨挑戰(zhàn)。

賴氨酸殘基通常定位于親水性蛋白質(zhì)表面,其側(cè)鏈伯氨基的化學(xué)標(biāo)記反應(yīng)性取決于其溶劑可及性和微環(huán)境非共價(jià)相互作用。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)表面與微/納米材料結(jié)合時(shí),結(jié)合界面上賴氨酸的溶劑可及性和反應(yīng)性均隨之降低。因此,王方軍等提出了賴氨酸的反應(yīng)性變化是探測(cè)蛋白質(zhì)-微/納米材料復(fù)合體中蛋白質(zhì)定位方向、相互作用序列區(qū)域、關(guān)鍵結(jié)合位點(diǎn)、材料結(jié)合引起蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化的有效指標(biāo)。該團(tuán)隊(duì)發(fā)展了在蛋白質(zhì)—微/納米材料復(fù)合體活性和變性條件下的兩步同位素二甲基化標(biāo)記的標(biāo)準(zhǔn)化策略,結(jié)合質(zhì)譜定量分析實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)上賴氨酸反應(yīng)性的全面分析,研究通過(guò)材料結(jié)合前后賴氨酸標(biāo)記反應(yīng)性的顯著性差異確定蛋白質(zhì)-材料的界面序列區(qū)域和關(guān)鍵位點(diǎn)。

王方軍團(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期從事生物大分子結(jié)構(gòu)質(zhì)譜尖端儀器和創(chuàng)新方法研究,所發(fā)展的LRP-MS策略近年來(lái)已應(yīng)用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-小分子、蛋白質(zhì)-微/納米材料的界面相互作用分子機(jī)制解析,取得了系列研究進(jìn)展。

近日,相關(guān)研究成果以Structural Characterization of the Protein-Material Interfacial Interactions Using Lysine Reactivity Profiling-Mass Spectrometry為題,發(fā)表在《自然-實(shí)驗(yàn)手冊(cè)》(Nature Protocols)上。研究工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金和大連化物所創(chuàng)新基金等的支持。

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